李雪玲
文章来源:     发布时间:2017-12-21
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李雪玲,中国科学院合肥肿瘤医院医学病理部、中国科学院合肥物质科学研究院医学物理与技术中心分子病理研究室研究员,中组部“千人计划”候选人。1999年毕业于烟台师范大学(现鲁东大学)生物系获学士学位;2002年毕业于华东师范大学生命科学学院获硕士学位;2007年毕业于中国科学院上海微系统与信息技术研究所获博士学位,2007-2011年任中国科学院合肥智能机械研究所助理研究员、副研究员。2011.4月起,在美国德克萨斯大学医学分部做博士后研究;20164-10月任美国德克萨斯大学健康研究中心高级科学家;2016年底加入中国科学院合肥物质科学研究院医学物理中心及中国科学院合肥肿瘤医院,任研究员,筹建肿瘤基因组学实验室,面向临床肿瘤早发现、早治疗和个性化医疗。

职称:研究员

学科方向:生物信息学

研究领域

主要研究方向包括生物信息学、机器学习、数据挖掘、计算生物学、系统生物学、肿瘤基因组学以及二代测序数据分析方法研究等。

发表论文

已在The  The Journal of Biological ChemistryBMC Genomics, BMC Bioinformatics, Molecular and Cellular Proteomics等杂志上发表论文30余篇[1-7]。目前承担及已经结题的研究课题包括海外引进人才启动经费、国家自然科学基金面上项目两项、安徽省自然科学基金面上项目一项、美国癌症预防与研究项目一项、中科院知识创新项目一项等,参加国家自然科学基金重点项目一项。

1. Li X, Chen G, Fongang B, Homouz D, Rowicka M, Kudlicki A: The High-resolution Timeline of Expression of Ribosomal Protein Genes in Yeast. bioRxiv 2017.

2. Yang J, Zhao Y, Kalita M, Li X, Jamaluddin M, Tian B, Edeh CB, Wiktorowicz JE, Kudlicki A, Brasier AR: Systematic Determination of Human Cyclin Dependent Kinase (CDK)-9 Interactome Identifies Novel Functions in RNA Splicing Mediated by the DEAD Box (DDX)-5/17 RNA Helicases. Mol Cell Proteomics 2015, 14(10):2701-2721.

3. Tian B, Li X, Kalita M, Widen SG, Yang J, Bhavnani SK, Dang B, Kudlicki A, Sinha M, Kong F et al: Analysis of the TGFβ-induced program in primary airway epithelial cells shows essential role of NF-κB/RelA signaling network in type II epithelial mesenchymal transition. BMC Genomics 2015, 16(1):529.

4. Li X, Zhu M, Brasier AR, Kudlicki AS: Inferring Genome-Wide Functional Modulatory Network: A Case Study on NF-κB/RelA Transcription Factor. Journal of Computational Biology 2015, 22(4):300-312.

5. Finnerty C, Li X, Fongang B, Nainar P, Gibran N, Gamelli R, Kudlicki A, Herndon D: THE TIMELINE OF GENOMIC RESPONSE TO BURN INJURY. In: 2014. 25.

6. Li X, Zhao Y, Tian B, Jamaluddin M, Mitra A, Yang J, Rowicka M, Brasier AR, Kudlicki A: Modulation of Gene Expression Regulated by the Transcription Factor NF-κB/RelA. Journal of Biological Chemistry 2014, 289(17):11927-11944.

7. Wang S-L, Li X-L, Fang J: Finding minimum gene subsets with heuristic breadth-first search algorithm for robust tumor classification. BMC Bioinformatics 2012, 13(1):178.

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