中国科学院合肥肿瘤医院临床研究中心成立于2023年1月，是医院科技创新体系的重要组成部分，具有业务与管理的双重功能，履行研究、服务、管理、支撑与统筹的职责,包括药物临床试验机构与医疗器械临床试验机构，主要承接以注册为目的的Ⅰ-Ⅳ期药物、医疗器械临床试验项目和研究者发起的临床研究（IIT）项目。

临床试验机构设主任1名，副主任3名，机构办公室主任1名，秘书1名，质量管理员2名，药物/器械管理员2名，档案管理员1名。机构设有办公室、会议室、档案室、GCP药房等办公场所并配备了相应的设施设备。药物临床试验机构已于2023年9月在国家药监局网站成功备案（备案号：药临床机构备字2023000071），备案专业有肿瘤专业，药物Ⅰ期临床试验专业、生物等效性专业。医疗器械临床试验机构已于2020年8月在国家药监局网站成功备案（备案号：械临机构备202000082），备案专业19个：呼吸内科专业、消化内科专业、普通外科专业、重症医学科、临床体液、血液专业、临床微生物学专业、临床化学检验专业、临床免疫、血清学专业、临床细胞分子遗传学专业、病理科、X线诊断专业、CT诊断专业、磁共振成像诊断专业、超声诊断专业、心电诊断专业、放射治疗专业。

临床试验机构建立了较完善的临床试验质量管理和保证体系，制定了机构及专业的质量管理体系文件共计200余项，涵盖了临床试验所涉及的主要环节。机构已组织200余人次参加了国家级及省级的GCP培训，并取得证书。同时聘任了业内知名专家全职来机构开展工作。